感染性疾病起病急、进展快,微生物检测可早期精准识别病原体,为临床感染性疾病早期、有针对性地采用恰当的治疗方案提供重要依据。同时,助力细菌的耐药性监测、医院院内感染的监控预防。
微生物质谱技术平台临床应用已趋于成熟。高效、准确的微生物鉴定是后续一切诊断、治疗的基础。细菌的核糖体蛋白具有保守性,一般不会跟随生长条件的变化而变化,而不同细菌的核糖体蛋白指纹图谱具有各异性,指纹图谱中的某些峰具有属、种,甚至亚种特异性。同时,同种细菌在同一培养条件下生长,所得到的质谱结果具有可重复性。微生物质谱技术平台成本低、速度快,准确率极高,对常见病原细菌或酵母菌的鉴定准确率高达95%,获临床高度认可。
> 微生物鉴定各类技术对比
(数据来源:动脉橙数据库,蛋壳研究院制)
微生物质谱技术平台国产化程度非常高。微生物质谱平台基于定性检测的基质辅助激光解析电离飞行时间质谱仪,定性检测仪器对灵敏度要求较低,技术原理较简单,操作较便捷,且微生物质谱几乎不使用试剂耗材,故微生物质谱平台已实现高度国产化。全球范围内,布鲁克、梅里埃、融智生物、安图生物、毅新质谱、中元汇吉等多家企业的基质辅助激光解析电离飞行时间质谱仪均可开展微生物鉴定。
> NMPA批准的微生物质谱产品
(数据来源:国家药品监督管理局,蛋壳研究院制)
微生物质谱高度依赖质谱菌种鉴定数据库。微生物质谱通过检测获得微生物的蛋白质图谱,与数据库中的已知菌种图谱进行对比后,得出鉴定结果。因此,除技术本身的性能外,菌种鉴定数据库图谱的质量、数量都将直接影响鉴定的准确率和成功率。然而目前数据库还不够完善,地球上的微生物种类有数百万,可用于微生物质谱鉴定的仅有数千种,一定程度上限制了微生物质谱的准确性及可鉴定菌种的多样性。
随着获批的微生物质谱产品增加,质谱菌种数据库的搭建是企业间的核心竞争要素。菌种数据库搭建分为归纳法和演绎法,其中归纳法是主要方法。国外,布鲁克和美国 CDC 合作建立的微生物质谱数据库有近万个条目,梅里埃的质谱菌种数据库包含15000 株菌株,两家企业也由此在全球微生物质谱市场独步天下。国内,融智生物是少见的使用演绎法的企业,数据库包括超过1800个菌属、6600个菌种(细菌、真菌),通过找出每个菌种的保守基因作为特征指纹,鉴定准确性更高。
> 企业质谱菌种数据库情况
(数据来源:动脉橙数据库,蛋壳研究院制)
2020年10月20日,硕世生物与融智生物宣告达成战略合作,标志硕世生物正式进入微生物质谱领域。双方共同基于「融智生物病源双维鉴定质谱系统」,打造智慧型解决方案,助力疫情防控及感染性病原体的鉴别诊断。
> 2020年10月 硕世生物与融智生物签署战略合作协议
> 融智生物全流程解决方案
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